水土保持与荒漠化防治专业成立于1979年，1984年获硕士授予权；1992年增设沙漠治理专业，同时成为林业部重点学科；1996年国家本科专业调整，两专业合并为“水土保持与荒漠化防治”专业。1999年原西北林学院水保系、西北农业大学水保系、中科院水保所和陕西省黄土高原治理所整合，2000年获博士授予权。2024年成立水土保持科学工程学院，该专业成为水保一级学科核心专业。在学院水保系教学管理与实践下逐渐形成了政府部门、科研院所、生态企业、国家生态网野外台站4方协同和师资队伍、教学内容、实践教学平台、育人方式4个教学基础拓展的“4+4”人才培养模式，凝聚了一支由院士、教授、研究员和工程师组成的“多元型”教学团队，搭建了融水保情怀培养的递进式实践育人平台，形成了以“学生为中心、产出为导向、持续改进为保障”的育人环境，“农工交融、多科交叉，科教联合、院所协同”的办学特色，推进了全国同类专业办学水平的提高。
该专业人才培养目标为积极契合国家生态文明建设发展战略人才需求，培养新时期德、智、体、美、劳全面发展，懂理论技术、解行业趋势、具国际视野、备创新能力、拥三农情怀，掌握水土保持与荒漠化防治专业基本理论、基本知识和基本技能，能在水保、农林业、环保、国土资源、城乡建设等科教部门与企事业单位，从事关于水土流失与荒漠化防治、生态环境恢复、林业生态工程和水保工程建设等方面的科学研究、规划设计、方案编制、施工监理监测、预防管理和教育培训及科研工作的高素质创新创业领军人才。
系主任：佟小刚
副系主任：刘加彬 王浩
